banner

Blog

Jul 23, 2023

L'orologio trascrittomico predice i cambiamenti vascolari della retinopatia diabetica prodromica

Rapporti scientifici volume 13, numero articolo: 12968 (2023) Citare questo articolo

494 accessi

2 Altmetrico

Dettagli sulle metriche

La retinopatia diabetica è una complicanza comune del diabete a lungo termine e che potrebbe portare alla perdita della vista. Sfortunatamente, la retinopatia diabetica precoce rimane poco conosciuta. Non esiste un modo efficace per prevenire o trattare la retinopatia diabetica precoce finché i pazienti non sviluppano stadi successivi della retinopatia diabetica. L'elevata densità capillare acellulare è considerata un tratto quantitativo affidabile presente nello sviluppo iniziale della retinopatia. Pertanto, in questo studio, abbiamo interrogato interi cambiamenti trascrittomici vascolari retinici tramite un modello di ratto del Nilo per comprendere meglio la patogenesi precoce della retinopatia diabetica. Abbiamo scoperto la complessità delle associazioni tra la densità capillare acellulare e i fattori congiunti di glucosio nel sangue, dieta e sesso, che è stata modellata attraverso una rete bayesiana. Utilizzando regressioni segmentate, abbiamo identificato diversi modelli di espressione genica e termini di Gene Ontology (GO) arricchiti associati all'aumento della densità capillare acellulare. Abbiamo sviluppato un modello di regressione forestale casuale basato su modelli di espressione di 14 geni per prevedere la densità capillare acellulare. Poiché la densità capillare acellulare è un tratto quantitativo affidabile nella retinopatia diabetica precoce, il nostro modello può essere utilizzato come orologio trascrittomico per misurare la gravità della progressione della retinopatia precoce. Abbiamo anche identificato NVP-TAE684, geldanamicina e NVP-AUY922 come i tre principali farmaci potenziali che possono potenzialmente attenuare la DR precoce. Anche se in futuro avremo bisogno di più studi in vivo per supportare i nostri farmaci riconvertiti, abbiamo fornito un approccio basato sui dati per la scoperta dei farmaci.

La retinopatia diabetica è una complicanza comune del diabete a lungo termine che provoca danni ai vasi sanguigni della retina e può progredire fino alla perdita della vista. In diversi paesi sviluppati, inclusi gli Stati Uniti, la retinopatia diabetica è la principale causa di nuovi casi di cecità tra gli adulti di età compresa tra 20 e 741 anni. Le persone che vivono con il diabete, indipendentemente dai sottotipi clinici, hanno circa un terzo delle possibilità di sviluppare retinopatia diabetica2 , che colpisce in modo simile sia i maschi che le femmine in generale3,4.

Nelle fasi iniziali, la retinopatia diabetica non proliferativa (DR) può essere rilevata mediante screening quando la vista non è ancora compromessa. Tuttavia, non esiste un modo efficace per rallentare o arrestare la progressione della malattia per prevenire la perdita della vista, per la quale i pazienti vengono spesso lasciati non trattati fino alle fasi successive. Inoltre, la retinopatia diabetica non è reversibile e continuerà a progredire. Alla fine, alcuni casi si svilupperanno in retinopatia diabetica proliferativa, in cui si sviluppa fibrosi sulla superficie retinica e nuovi vasi anomali soggetti a emorragia portano alla perdita della vista5. Per prevenire la perdita della vista dovuta alla retinopatia diabetica, dobbiamo comprendere la patogenesi precoce della retinopatia asintomatica. Sfortunatamente, questi primi processi rimangono poco compresi, in parte a causa dell’insufficienza di materiale istologico proveniente da donatori umani e di modelli animali limitati in grado di ricapitolare la progressione naturale della retinopatia diabetica umana6.

Il ratto del Nilo (Arvicanthis niloticus), originario dell'Africa settentrionale, è un roditore diurno con una dieta generale a base di steli d'erba7. Tuttavia, quando alimentato con un cibo convenzionale per roditori in un ambiente di laboratorio, il ratto del Nilo sviluppa rapidamente il diabete indotto dalla dieta in entrambi i sessi. Per chiarire, il cibo convenzionale per roditori, sebbene destinato a sostenere in salute i comuni roditori da laboratorio, è ipercalorico, rispetto alla dieta nativa, per le specie di ratti del Nilo e sarà successivamente descritto come una dieta ad alto contenuto calorico. Per prevenire il diabete indotto dalla dieta in un ambiente di laboratorio, il ratto del Nilo può essere alimentato con una dieta ricca di fibre8. Pertanto, il diabete indotto dalla dieta nel ratto del Nilo sembra seguire la progressione naturale del diabete di tipo 2 negli esseri umani. Il nostro studio precedente ha dimostrato che i ratti diabetici del Nilo potrebbero sviluppare retinopatia con lesioni retiniche avanzate simili alle caratteristiche cliniche legate alla perdita della vista negli esseri umani, come edema maculare, mancata perfusione capillare e retinopatia diabetica proliferativa9. Nello specifico, le lesioni dei ratti del Nilo includevano perdita retinica, ispessimento retinico, mancata perfusione capillare, anomalie microvascolari intraretiniche e apparente retinopatia diabetica proliferativa, sulla base della neovascolarizzazione osservata oltre la superficie retinica9. Tipicamente, altri modelli di roditori con retinopatia diabetica indotta dalla dieta non mostrano l’esatto danno microvascolare osservato negli esseri umani e spesso mancano di neovascolarizzazione proliferativa. Tuttavia, la neovascolarizzazione è stata osservata in ratti del Nilo relativamente più anziani e l'età potrebbe svolgere un ruolo nella neovascolarizzazione. In quello studio, abbiamo anche dimostrato che l'elevata densità capillare acellulare è un tratto quantitativo affidabile presente nello sviluppo iniziale della retinopatia, che precede un'ulteriore disfunzione vascolare nei periciti e nelle cellule endoteliali9. L'uso della densità capillare acellulare retinica come uno dei primi marcatori di retinopatia è coerente sia nel ratto del Nilo9 che nell'uomo10. Pertanto, abbiamo ritenuto che il cambiamento della vascolarizzazione retinica sia un importante fattore causale nell’avvio e nel guidare la patogenesi della retinopatia diabetica. Poiché la densità capillare acellulare retinica è uno dei cambiamenti iniziali rilevabili rilevanti per la disfunzione vascolare retinica, potremmo utilizzare la densità capillare acellulare per contrassegnare la progressione precoce della malattia nella retinopatia diabetica.

 100 mg/dL9. Hence, we could investigate if diet could affect acellular capillary density independent of RBG. Additionally, since retinopathy can have differences between males and females, we also included sex in our acellular capillary density analysis. To understand individual factors contributing to increased acellular capillary density, we developed a Bayesian network (BN) to calculate the conditional probability of high acellular capillary density based on RBG, diet, and sex. As shown in Fig. 2C, the likelihood of a high acellular capillary density is progressively increased when factors of blood glucose level, diet, and sex are combined. For example, a Nile rat on a high-caloric diet will have a 43.07% chance of developing acellular capillary density greater than 10 counts per mm2. This probability increases to 62.0% if this Nile rat also has an RBG > 100 mg/dL. Furthermore, if this Nile rat is male, the possibility will further increase to 80.56%. Hence, a male Nile rat on a high-caloric diet with a high blood glucose level will have a much higher chance of presenting high acellular capillary density, a quantitative marker for early retinopathy./p> 10 counts per mm2) suggests that combined factors of high RBG, high-caloric diet, and the male will result in a twofold increase the likelihood of high ACD than any factors alone./p> 0.4; Fig. 5). Absolute Rho values greater than 0.4 are generally considered to have correlated patterns31. We then searched LINCS L1000 chemical compound perturbated gene expression database32 to find drugs that could potentially reverse this pattern (i.e., a compound that can down-regulate the gene expression for acellular capillary density positively correlated genes while up-regulating the gene expression for acellular capillary density negatively correlated genes). We found NVP-TAE684, geldanamycin, and NVP-AUY922 to be the top three compounds identified to potentially reverse the retinal vascular phenotype associated with high acellular capillary density (Fig. 5). NVP-TAE684 is an anaplastic lymphoma kinase (ALK) inhibitor. ALK is a receptor tyrosine kinase belonging to the insulin receptor superfamily sharing a high degree of homology with leukocyte tyrosine kinase (LTK)33. Both geldanamycin and NVP-AUY922 are Hsp90 inhibitors11,12. Interestingly, studies have shown that a short-time treatment of Hsp90 inhibitor can stimulate a retina stress response with molecular chaperone expression, preventing retinal degeneration in models of retinitis pigmentosa and age-related macular degeneration13. Although no study shows that Hsp90 inhibitors can be used to treat early retinopathy, there is evidence that Hsp90 inhibitors, such as AUY922, can protect and repair microvascular endothelial cells related to endothelial barrier dysfunction in a different biological context (e.g., human lung34). Retina endothelial dysfunction is a significant complication that drives diabetic retinopathy35,36. Hence, it is likely that Hsp90 inhibitors (geldanamycin and NVP-AUY922) can potentially treat or protect early retinopathy via modulating microvascular endothelial cells./p> 0.4 between gene expression values and acellular capillaries density (ACD). Searching LINCS L1000 chemical compound perturbated gene expression database identified NVP-TAE684, geldanamycin, and NVP-AUY922 as the top three candidates./p>

2.0.co;2" data-track-action="article reference" href="https://doi.org/10.1379%2F1466-1268%282001%29006%3C0105%3Agtpoac%3E2.0.co%3B2" aria-label="Article reference 12" data-doi="10.1379/1466-1268(2001)0062.0.co;2"Article CAS PubMed PubMed Central Google Scholar /p>

CONDIVIDERE